黄道周一般被认为是理学家、朱子学者，但又是颇具创造性的经学家，故本书从朱子学的论域出发，采取经学与理学交融互涉的视角，以翔实的文献资料为基础，附以必要的图表，较为全面地论证了黄道周对朱子易学、礼学、理学的发展与创新，同时指出其于中国学术思想目前的贡献。全书共分五个部分：章主于区域儒学，从朱子与高东溪学派之关系入手，探讨朱子对漳州（闽南）儒学、书院乃至对黄道周生平思想之影响，进而揭示地方儒学研究之价值；第二章主于易学，从“《孟子》是否知《易》”这个学术史问题出发，探讨黄道周在朱子、邵雍易学影响下对理学、经学之融通；第三章主于礼学，分析黄道周对朱子《家礼》之践行及其礼学著作之特点，重点阐述《儒行集传》的君臣伦理观；第四章主于理学，阐述黄道周论“朱王异同”的学术价值，探讨其以“致知”为工夫、以“至善”为本体、以“乐性”为旨归的心性思想及其实践；第五章主于信仰，分析黄道周早年信仰的民间色彩与道教内涵，探讨其后所奉祀“五十六贤”及以朱子为首的“九先生”之经世意义与重建道统之努力，及其自身信仰化之过程。五个部分各有侧重又相互联系，将学术发展史、理学范畴与文献分析进行有机结合，从而努力使本书的观点更具客观性和说服力。

章 朱子与漳州儒学之进路
一 朱子之前的漳州儒学
二 朱子与“高东溪学派”
三 朱子对漳州儒学的影响
四 朱子与漳州书院
五 朱子学对黄道周的影响
第二章 “孟子不说《易》”与“孟子知《易》”——黄道周对朱子易学思想的发展
一 问题的提出：孟子是否知《易》？
二 黄道周论“孟子知《易》”
三 黄道周“孟子知《易》”说的朱、邵渊源
四 刘宗周与焦循对“《孟子》知《易》”的看法
五 小结：“面前路径须常令宽”
第三章 “家礼”与“儒行”——黄道周对朱子礼学思想的发展
一 朱子之《家礼》与黄道周对《家礼》之践行
二 黄道周的礼学著作
三 黄道周《儒行集传》的君臣伦理观
第四章 “致知”与“乐性”——黄道周的功夫与本体论
一 “致良知”与“致知”：黄道周论“朱王异同”
二 从“性善”到“乐性”：黄道周的“善本论”及其对“性命”之道的体证
三 余论：“圣贤本心”与“忧乐天下”
第五章 崇拜与奉祀——黄道周的信仰世界
一 《九诉》中的道教神灵与民间信仰
二 “十朋轩”与“九串阁”的政治寄托
三 书院奉祀与尊崇朱子
四 黄道周信仰：从官方到民间
引用文献