《文学少女.见习生的初恋》进入圣条学园就读的日坂菜乃认识了一位学长──文艺社社长井上心叶。菜乃受到心叶的吸引后选择加入了文艺社，但是心叶的心已经被一位“文学少女”占据了，菜乃为毫无希望的感情陷入低潮。但是，当她被卷入某桩事件而陷入困境时，心叶却对她说：“我发誓，不会再对你视若无睹，也不会再撇开视线。”描述身为文学新手的少女探索隐藏在故事中的真相，另一位“文学少女”的故事就此登场！《文学少女.见习生的伤心》“我讨厌你！”心叶对菜乃说了这句话，从此不再显露真心，只以伪装的笑容对待她。菜乃心想不能再这样下去，所以在暑假采取了某种行动……伤心的夏天过去后，秋天来临了，菜乃在热闹校园迎接文化祭时又有了新的邂逅——一位背负着不祥阴影的少女。和少女来往后，菜乃发现她、心叶以及七濑心中各自的黑暗与光芒。这是另一位“文学少女”的故事......《文学少女.见习生的毕业》“你明白了吧？少碍事。”菜乃听到好友瞳口出此言的同时又得知了心叶竟然在和瞳交往！在震惊中，她却又见到了三年前传出瞳害死人的谣言时和瞳有关的某人。“如果小瞳有麻烦，我*不能坐视不理！”菜乃下定决心展开行动时，心叶给了她一本书……瞳的心底到底埋藏了什么样的秘密？菜乃和心叶离别在即，她的初恋又将何去何从？

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