王原祁的用色亦十分讲究，他讲：“设色可以补笔墨之不足，显笔墨之妙处，今人不解引意，色自为色，笔墨自为笔墨。”（《麓台题画稿》）“故墨中有色，色中有墨。”（同上）色和墨的关系一直是水墨画的一个难题，王原祁提出了色和墨的互补关系，颜色应该起到衬托笔墨的作用，同时他又提出墨也是色，解决了色墨关系中的一个比较重要的问题。他用色的方法很多，有时很薄，有时很厚，但都恰到好处，有时他将墨和色调到一起使用，使色和墨浑然一体，这种方法在古代画家中也比较独到。他用色不多，画面却感觉非常丰富，这是值得我们研究和学习的。