《古菌——生命的奥秘》是由张传伦教授主持撰写的专门介绍古菌的微生物学领域科普教材。古菌，虽然和细菌、真核生物一起构成了生物的三域系统，但对于大多数人来说还是非常陌生的。出版本书的目的就是希望把深奥晦涩的科学以深入浅出的形式介绍给大家。本书由浅入深，将今论古，从古菌的定义、特征、培养至古菌在地球化学上的应用概述了国内外学者30多年来对古菌的研究，从古菌与地球共演化谈到古菌与人类生存息息相关的问题。全书以基础知识为主，穿插介绍国内外古菌研究的突破性进展，可以较好地为初涉古菌领域的同学和科普爱好者提供帮助。

前言
第1章古菌1
1.1古菌的定义1
1.2古菌的特征3
1.3古菌系统分支多样性7
1.3.1广古菌门（Euryarchaeota）8
1.3.2泉古菌门（Crenarchaeota）11
1.3.3纳米古菌门（Nanoarchaeota）13
1.3.4初古菌门（Korarchaeota）13
1.3.5深古菌门（Bathyarchaeota）14
1.3.6奇古菌门（Thaumarchaeota）18
1.3.7海洋异养浮游古菌（MG-II）21
1.3.8海洋底栖古菌26
1.3.9附着或寄生、共生在海洋动植物上的古菌28
1.4古菌的代谢类型、繁殖方式及分离培养30
1.4.1古菌的代谢类型30
1.4.2古菌的繁殖方式31
1.4.3古菌的分离培养31
1.5古菌病毒35
1.6古菌膜脂41
1.6.1古菌GDGTs（iGDGTs）42
1.6.2测试方法44
第2章古菌、细菌和真核生物47
2.1细菌（Bacteria）47
2.2真核生物（Eukarya）47
2.3细菌和真核生物与古菌的差异47
2.4真核生物与古菌的演化关系49
2.5细菌支链四醚膜脂来源50
第3章古菌在地球科学上的应用53
3.1古菌温度计TEX8653
3.2BIT陆源输入指标56
3.3甲基化指数（MBT）和环化率（CBT）58
第4章古菌与地球演化61
4.1地球上最早的生命61
4.2古菌与地质过程64
4.3海洋古菌在全球碳循环中的作用66
4.4古菌与全球变暖68
4.5古菌生物标志物与地球演化69
第5章古菌与人类以及社会生产71
5.1古菌与人体71
5.2古菌与经济72
5.3古菌与环境保护74
第6章古菌12问78
参考文献85