王勇献、王正华编著的《生物信息学导论——面向高性能计算的算法与应用》选择生物信息学中与计算技术关系最密切的生物序列分析、蛋白质组学分析、生物学网络分析等三个专题进行重点阐述，同时将所需的生物知识、数学知识、计算机算法等作为预备知识。

在每部分专题内容中，既有对经典方法的详细讨论，也融入了作者及其合作研究者最近几年研究的创新成果；既注重理论研究的方法，也强调具体应用的实现。

在介绍各类生物信息学问题的求解方法时，特别关注如何与高性能计算技术相结合，力求体现分子生物学知识、数学模型和高性能计算方法相融合的特点。

王勇献、王正华编著的《生物信息学导论——面向高性能计算的算法与应用》主要针对生物信息学中的典型应用，从计算方法角度介绍相关算法的原理及应用；内容分成生物学及数理基础、生物序列分析、蛋白质组学分析以及大规模生物学网络分析等四个专题，涉及生物分子序列分析、基因发现、分子进化分析、蛋白质结构预测、蛋白质肽测序、生物学网络模块划分等具体问题的求解原理及算法实现。

《生物信息学导论——面向高性能计算的算法与应用》的读者对象是具有现代分子生物学及计算机科学基本知识的研究生及相关科研人员，在附加习题后也可作为生物信息学方面的入门及进阶教材，供生物医学工程、计算机应用等专业学生使用。

第一篇 预备知识篇

 第1章 分子生物学基础

1.1 生命的演化与分类

1.2 核酸：DNA与RNA

1.3 蛋白质

1.4 DNA的复制

1.5 基因与染色体

1.6 基因表达

 1.6.1 转录

 1.6.2 遗传密码

 1.6.3 基因的进化——遗传与变异

1.7 现代生物工程技术

1.8 现代分子生物学中的经典计算问题

 第2章 数学及计算机科学基础

第二篇 序列分析篇

 第3章 序列比对的基本方法

 第4章 序列比对的并行计算

 第5章 基于字符串精确匹配的序列比较

 第6章 基因识别

 第7章 马氏链与隐马氏模型

 第8章 序列进化的基本模型

 第9章 分子进化树的重构

第三篇 蛋白质组学分析篇

 第10章 蛋白质的结构预测

 第11章 蛋白质序列鉴定的质谱分析

第四篇 生物学网络分析篇

 第12章 蛋白质相互作用的预测

 第13章 生物学网络的模块划分

 第14章 大规模网络的数据挖掘技术

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参考文献