宝音朝克图著的《中国北部边疆的治理》由导论、正文、结语、参考书目和插图等组成。正文分“秦汉对北疆的治理”“隋唐对北疆的治理”“元明对北疆的治理”“清朝对北疆的开拓”“清朝对北疆的治理”“民国对北疆的治理”“中华人民共和国对北疆的治理”等七章，分别对特定时期中央政府的治边思想、方针、政策、措施及其得失进行阐述。

导论

第一章 秦汉对北疆的治理

 第一节 开拓先河：秦统一前的北疆局势

一、秦统一前的北疆民族

二、秦统一前各朝对北疆的开拓

 第二节 治理雏形：秦朝对北疆的治理

一、秦代的北疆民族

二、秦朝对北疆的开拓

三、秦朝对北疆的治理

 第三节 汉匈之争：汉朝对北疆的开拓

一、汉代的北疆民族

二、汉朝对北疆的开拓

 第四节 宗藩之交：汉朝对北疆的治理

一、汉朝统治北疆的政策

二、汉朝统治北疆的机构

三、汉朝对北疆的开发

 小结

第二章 隋唐对北疆的治理

 第一节 成雄交替：魏晋至隋唐时期的北疆局势

一、魏晋南北朝时期的北疆民族

二、各朝对北疆的经略

 第二节 隋唐对北疆的开拓

一、隋唐时期的北疆民族

二、隋朝对北疆的开拓

三、隋朝统治北疆的机构

四、唐朝收服北疆

 第三节 治边有道：唐朝对北疆的治理

一、唐代的治边思想

二、唐代的治边政策

三、唐代的治边机构

 小结

第三章 元明对北疆的治理

 第一节 群雄割据：元朝统一前的北疆局势

一、五代至两宋时期的北疆局势

二、宋朝对北疆的经略

 第二节 霸主北疆：元朝对北疆的开拓

一、大蒙古国及其北疆经略

二、大蒙古国统治北疆的机构

三、元朝的建立与收复北疆

 第三节 治边大成：元朝统治北疆的机构

一、元朝统治北疆的中央机构

二、元朝统治北疆的地方机构

三、保障蒙古人的社会地位

四、便捷通达的驿路交通

 第四节 元朝对北疆的开发

一、保护和发展北疆畜牧业

二、发展北疆农工商业

 第五节 南北对峙：明朝对北疆的经略

一、明朝与北元的对峙

二、明朝对北元的政策

三、明朝统治北疆的管理机构

四、明朝与北元的经济往来

 小结

第四章 清朝对北疆的开拓

 第一节 北疆归顺：清朝对北疆的开拓

一、清朝统一前的北疆局势

二、满族的崛起

三、漠南蒙古归附清朝

四、漠北蒙古归附清朝

 第二节 华夷划界：清朝对北部边疆的治理

一、清朝政府的治边思想

二、沙俄东扩及中俄边界的划定

三、清朝的北疆边界管理

 小结

第五章 清朝对北疆的治理

 第一节 编旗设阻：分而治之的地方组织

一、外藩蒙古——盟旗制度

二、内属蒙古——总管旗及都统旗

三、蒙古八旗

四、封禁隔离政策

 第二节 羁縻教化：因俗而治的政教制度

一、封爵制度

二、满蒙联姻制度

三、朝觐制度

四、兴黄教政策

 第三节 皇权之威：清朝统治北疆的机构

一、理藩院

二、军府制度制——将军、都统、大臣

三、法律制度

 第四节 封禁休养：清朝治理北疆的经济政策

一、“休养生息”的畜牧业经济

二、明禁暗弛的农业经济

三、“封禁”之下的工商业

 第五节 推行新政：晚清对蒙政策的转变

一、晚清新政的背景

二、政治与军事领域的“新政”

三、经济领域的“新政”

四、北疆边政建置的调整

 小结

第六章 民国对北疆的治理

 第一节 独立之危：辛亥革命对北疆的影响

一、辛亥革命对北疆的影响

二、外蒙古“独立”风波

三、内蒙古东部地区的“自治”“独立”闹剧

 第二节 安抚争夺：北京国民政府对北疆的管理

一、北京国民政府处理外蒙古“独立”

二、各系军阀争夺热、察、绥控制权

 第三节 专制同化：北京国民政府治理北疆的机构与政策

一、管理边疆地区的中央机构

二、省级军政机构“都统府”的设置

三、怀柔羁縻的统治政策

四、“放垦蒙地”的掠夺政策

 第四节 怀柔欺压：国民政府统治北疆的政策与机构

一、国民政府统治北疆的理论导向

二、管理北疆的中央机构

三、分而治之的地方机构

四、蒙地放垦

 第五节 自治之辩：国民政府处理内蒙古自治问题

一、《盟部旗组织法》的制定和实施

二、国民政府处理内蒙古高度自治

 小结

第七章 中华人民共和国对北疆的治理

 第一节 北疆曙光：内蒙古民族区域自治的实现

一、民族区域自治理论及其实践

二、内蒙古区域自治运动的发展

三、内蒙古统一民族区域自治的实现

 第二节 中俄中蒙国界内蒙古段划界

一、中俄内蒙古段国界的划定

二、北疆中蒙国界的划定

三、中蒙内蒙古段国界现状

四、中蒙边境睦邻关系

 第三节 安泰边境：北疆边境管理机制

一、北疆边防政策及其完善

二、北疆边防管理机构的建立与完善

三、北疆边防建设的成效

 小结

参考书目