医学通论总部查阅文献近二干部（种），实际采录五百三十余种。所釆文献均编排于本总部之后的《引用书目表》，以供读者稽核、参考。由于本总部的特殊性，如既需搜编一部丛书的序跋，同时又需搜编其子目书中的资料且需下悖于相关规定，故《引用书目表》如实编排了所采用过的丛书及其子目书。

本总部搜录编纂中国古代属于医学领域的、宏观总体性的论述。这些论述，长期以来总揽着医学全局，指导着医学方向，在医学发展史上具有重要意义和巨大影响，一直被历代学者和医家所重视。故《中华大典，医学分典》中首列医学通论总部。其具体内容和纬目，依照“有则设之，无则下设”的编纂原则设置如下：

题解搜编有关“医”的医学概念、涵义内容，以明古代医学的定义及其范畴。而“医”的其它非医学意义、概念则下录。

著录搜编有关历代重要的综合性医着的目录学数据，包括文献的形成、发展、价值、刊刻、校理、著录、版本等内容，以医书序跋为主。

《医学通论总部》提要

医学通论总部

　题解

　著录

医道通论部

　论说

医德医业通论部

　论说

医学源流通论部

　论说

医易通论部

　论说

医治通论部

　论说

病家与医通论部

　论说

引用书目表