距今1000年后的未来世界，人类世界出现了一种名为“时空跃迁”的新技术，人们可以利用这种技术穿越时间和空间的界限，来往于不同的时空，地球与外星球之问的联系、交往也成为了现实。

与此同时，人类也面临着意想不到的麻烦以及外星球生命的误解。于是，为了维护时空秩序，跃迁技术的研发者克里斯托弗?欧文教授，召集了库亚、夏雨、辰这三个少年，组成了名为“时空少年”的组织，负责解决因时空混乱造成的各种麻烦……