本书是中国学者针对中国鼠疫流行史进行的首次详细而全面的讨论。两位作者积近十年研究所得，分别从鼠疫史的方法论、鼠疫流行模式(战争与和平时期)、环境变迁与国家医学等角度，深入探讨中国的鼠疫流行历史。本书不仅就鼠疫流行与中国环境变迁之间的关系提出了新的解释，而且对于700余年来中国社会历史的演进，提供了新的解释模式。如作者提出了极有意思的问题：“老鼠灭亡了明朝”。诸如此类的很多问题都值得我们深思。作者运用通俗流畅的表述疗式。使严谨的学术专著读来也饶有趣味。

第一编 研究的缘起、背景与概念／1

 第一章 楔子／3

 新大陆的故事／3

 医疗、疾病与鼠疫／7

 本书的思路／13

 关于资料和方法论问题 ／17

 第二章 疫鼠之家／21

 鼠疫的起源／21

 疫鼠之家 ／26

 退缩与扩张／34

 小结 ／48

 第三章 从文献中识别鼠疫／50

 民众视野中的鼠类活动／50

 民众对患者症状的描述 ／54

 鼠疫的异名 ／57

 “鼠疫”的出现／67

 小结 ／74

第二编 战争与灾荒：危机中的疫情／77

 第四章 转折的时代／79

 战马传播鼠疫／79

 元代的传说与事实／89

 从东方到西方／95

 人口的死亡 ／99

 小结／100

 第五章 老鼠“消灭”了明朝／102

 “生核”与“肿项” ／102

 万历疫情／103

 崇祯疫情／114

 北京的陷落／120

 南方的疫情／123

 环境与鼠疫／125

 战争与鼠疫／129  

 小结／131

 第六章 刀兵瘟疫／133

 一个假设／133

 刀兵瘟疫／135

 “害痒子死就两倍”：云南一楚雄 ／140

 “鼠疫死了十分之七”：大理一景东 ／148

 小结／155

第三编 和平年代：静悄悄地流行／157

 第七章 云南模式：地形与交通／159

 从村庄到村庄／159

 从市镇到村庄／166

 从市镇到市镇／173

 从县到县／176

 商路的意义／183

 疫死人口 ／185

 小结 ／190  

 第八章 粤闽模式：城市与乡村／192

 鼠疫与霍乱／192

 本土的还是外来的／197

 以城市为中心 ／206

 广东城市疫死人12／ ／210

 福建城市疫死人口／215

 乡村疫死人口 ／218

 小结 ／223

 第九章 东北模式：铁路与城市／224-

 草原上的捕獭者／224

 铁路和城市／229

 城市的防疫／237

 钱家店的故事／246

 小结 ／253

 第十章 西北模式：旱灾与生活方式 ／255

 祸起萧墙／256

 本地的与外来的／261

 挖鼠洞去／266

 从村庄到村庄／269

 从集市到村庄／275

 小结 ／280

 第十一章 西北模式：环境与生活方式 ／283

 康家湾的悲剧 ／284

 旱獭的诱惑／ 289

 流行链：家庭与部落／292

 寺院的故事／297

 野牛沟纪事／299

 小结 ／303

第四编 国家医学：环境与政治／305

 第十二章 南方的应对：医生、民众与政府／307

 医界的应对／308

 民众的应对／314

 官方的应对／321

 小结／327

 第十三章 上海的反应：从旁观者到当事人／329

 旁观者：纪实与猎奇／331

 当事人：预防与预后 ／336

 公共卫生：观念与行动／342

 小结／349

 第十四章 山西疫情：国家与地方的公共卫生／352

 1918年的全民防疫／354

 鼠疫还是禽流感／362

 西医和中医的实践／365

 传染病：从国家到地方 ／373

 小结／379

 第十五章 灭鼠拔源：20世纪50年代的内蒙古草原／381

 人民战争／382

 黄鼠的生境与生态 ／383

 从防御到进攻／390

 剿杀黄鼠的大跃进／396

 战略、战术与武器／405

 小结／411

第五编 结论／415

 第十六章 比较的视角：空间的意义／417

 县与县：以云南为例／417

 从南至北，由东徂西／424

 中国与欧洲／431

 环境哲学的实践／439

 简短的结论／442

图表索引／445

参考文献／447

后记／465