模型是科学研究中的一个重要方法，本书主要围绕两个进路展开对科学中的模型的哲学讨论：第一条进路是关于科学的语义模型研究；第二条进路是关于科学的表征模型研究。主要讨论的问题包括：科学模型的主要类型是什么？科学理论结构的语义模型论进路是否有可能被新的进路（例如语用观的进路，模型作为理论与实践的中间环节的进路）所代替？“科学语义模型”和“科学表征模型”之间是什么关系？二者是不是相容的？模型的“抽象性”与现实世界（模型的目标系统）的“具体性”之间的关系如何？“同构”或“部分同构”的观点是不是仍然有效？对这些问题的哲学讨论再回应到自然科学与社会科学中“基于模型的推理”案例中，形成对计算机模拟方法的哲学思考。最后将整个内容延展至对计算思维、计算理念以及自然界的数学结构与建模的美学标准方面的阐述。

绪论
第一章模型与世界的关系
一模型与虚构
二模型与表征
三现象、模型与定律的关系
四模型与理论
第二章模型的分类学研究
一模型的功能分类
二模型的本体论分类
三模型的认识论分类
四技术模型
第三章科学理论结构的语义模型
一科学理论结构的"公认观点"和"语法"进路
二语义模型论的兴起和它的基本观点
三语义模型进路的优点及面临的困难和出路
四科学理论研究的语用进路
五语义模型：突现与还原的新认识
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