《基础生物信息学分析实践教程》从初学者及应用的角度对生物信息学分析所涉及的几个方面进行了介绍，提供了一些重要的常用软件的基本性能、获取方法和简单的使用步骤，力图通过最简单直观的方式使初学者能在最短的时间内了解生物信息学软件的基本功能，而不着眼于对软件功能以及所涉及算法的全面介绍。全书共分为四章，从计算机基础知识入手，以核酸和蛋白质序列分析为重点，由浅入深地介绍涉及核酸与蛋白质序列分析与研究的各个方面。

1 美国国家生物技术信息中心（NCBI）网站相关应用
2 BLAST同源序列比对
3 多序列比对及其功能域预测
4 系统发育树构建
5 PCR引物设计及评价
6 荧光定量PCR分析基因表达量
7 基因预测分析
8 RNA二级结构分析
9 蛋白质结构分析及结构预测
10 GO分析基因功能
11 KEGG等代谢通路专业数据库
12 作物专属基因组数据库及其应用
13 Linux系统入门及编程基础
14 基因组重头拼接
15 转录组数据从头拼接
16 全基因组关联分析
参考文献