《内科摘要》是我国医学史上最早以内科命名的医著。书中所载之病案，以脾胃亏损和肾命亏损类居多。著者薛氏善于运用脏腑辨证，突出脾、胃、肾和命门虚损证的辨治，体现了其擅长温补脾胃、滋补肾命、脾肾并治的治学思想。薛氏尊崇李杲之脾胃学说，治病以脾胃为根本，临证多用补中益气汤等方剂以温补脾胃；并遥承王冰、钱乙之学，重视培补肾阴、肾阳，用六味地黄丸“壮水之主，以制阳光”、金匮肾气丸“益火之源，以消阴翳”。薛氏倡导脾肾同治，书中病案多有一日之内，朝服补脾胃之剂以培后天、夕服补肾命之剂以滋化源，或朝服补肾剂、夕服补脾剂，或脾肾补剂同服，以此治疗虚损，实有成效。薛氏在用药上倡导温补，一反元代医家多重视寒凉降火、克伐生气的治法，融李东垣脾胃之说及钱乙等肾中水火之说于一炉，加之作者自己的潜心研究与临床实践，而自成一家之言，对后世温补派的产生与形成起了重要作用。

卷之上
元气亏损内伤外感等症（一）
饮食劳倦亏损元气等症（二）
脾胃亏损心腹作痛等症（三）
脾肾虚寒阳气脱陷等症（四）
命门火衰不能生土等症（五）
肾虚火不归经发热等症（六）
脾胃亏损吞酸嗳腐等症（七）
脾肾亏损停食泄泻等症（八）
脾胃亏损停食痢疾等症（九）
脾胃亏损疟疾寒热等症（十）
脾肺亏损咳嗽痰喘等症（十一）
各症方药（十二）
卷之下
脾肾亏损头眩痰气等症（一）
肝肾亏损血燥结核等症（二）
脾肾亏损小便不利肚腹膨胀等症（三）
脾胃亏损暑湿所伤等症（四）（附：食生冷入房）
肝脾肾亏损头目耳鼻等症（五）
脾肺肾亏损小便自遗淋涩等症（六）
脾肺肾亏损虚劳怯弱等症（七）
脾肺肾亏损遗精吐血便血等症（八）
肝脾肾亏损下部疮肿等症（九）
脾肺肾亏损大便秘结等症（十）
各症方药（十一）
索引