《魏晋南北朝通史》是冈崎文夫的代表作，当它在1932年出版时，甚至中国国内也没有关于这一时期的断代史专著。这本著作极大影响了日本的中国中世史研究。全书分为内、外二编，内编为六朝政治史的概说，分魏晋时代、东晋五胡时代、南北朝时代（南朝篇）、南北朝时代（北朝篇）四章，主要探究魏晋南北朝时代权力的迁移；外编则分为“魏晋文明”“南朝文明”“北朝文明”三章，专述人文化成之迹，认为从南北朝时代到隋唐时代，国家法制有了极大的变化，继承了北朝国家体制、又包含了南朝文化的隋唐帝国由此开始走向历史舞台。

内编
第一章 魏晋时代
第一节 东汉宦官之害
第二节 内乱的发生与权力的分散
第三节 董卓之乱
第四节 曹操统一北部中国
第五节 三分之势形成
第六节 曹操、刘备称王号
第七节 三国分立及其纷争（一）
第八节 三国分立及其纷争（二）
第九节 魏室衰败，司马氏兴起
第十节 西晋的统一
第十一节 西晋的衰亡（一）
第十二节 西晋的衰亡（二）
第二章 东晋五胡时代
第一节 秦汉以来胡汉关系概述
第二节 北部中国匈奴兴亡始末
第三节 东晋——晋政权复活于江南
第四节 前燕、前秦始末及北部中国诸国
第五节 东晋的衰亡
第三章 南北朝时代（南朝篇）
第一节 刘宋的全盛期
第二节 宋的衰运
第三节 南齐的兴亡
第四节 梁武帝之治
第五节 北魏与齐梁的交涉以及侯景之乱
第六节 陈的兴亡
第四章 南北朝时代（北朝篇）
第一节 鲜卑拓跋部的迁移
第二节 北魏的兴隆
第三节 北魏的全盛
第四节 北魏的衰亡
第五节 新势力的兴起
第六节 北齐、北周的兴亡
外编
第一章 魏晋的文明
第一节 东汉的经术主义
第二节 东汉风俗的败坏
第三节 东汉末的乱离状况
第四节 汉末三国初期的政治论与曹操的统治方针
第五节 魏西晋间政术的转移（一）
第六节 魏西晋间政术的转移（二）
第七节 魏西晋间政术的转移（三）
第八节 魏西晋间思潮的转移（一）
第九节 魏西晋间思潮的转移（二）
第十节 魏西晋间思潮的转移（三）
第二章 南朝的文明
第一节 江域被化小记
第二节 建康的奠都与南地的文运
第三节 南朝治下江南的一般经济状况及中央政府的财政政策
第四节 南朝的社会制度
第五节 南朝的风俗思潮梗概
第六节 南朝的佛教
第三章 北朝的文明
第一节 “五胡之乱”期的北部中国
第二节 北魏的统治
第三节 北魏的政术
第四节 北齐北周政术概论
第五节 北朝佛教梗概
后记
译后记

此书内外编所收叙述的对象不同，著者所根据的资料亦复不同。内篇注重政治方面，以《资治通鉴》为骨干，间或参考八书二史，采撷比附。冈崎氏的文章很流畅，征引文字简短的照录原文，如果冗长或稍稍费解，他便用日文意译。既然是普通的叙述，而非考证，这办法对于东邦的读者反倒相宜吧。外篇注重制度文物和学术思想。前者虽然有《通典》《通考》和各史的志，但并不能完全抄录，许多地方还待整理和补充，至于学术思想更没有成书可以依据了。因此，外篇大抵是著者综合旧有史料研究的结果，也许可以说是此书精采所在。