当组织的魔爪步步逼近之时，在最后的钟声敲响之前，柯南能否冲破重重阻挠，来到暗影的边界？（摘：“虽然我不能再陪你了，但是，你必须完成任务啊。别忘了大家的寄托，别忘了大家的付出。只要云雾散去，一切，就会变得那么简单。所以，我相信你，小新一。”
看似乌云散去，可神奇的DNA又再次将两个人连接在一起。十七年前不可告人的秘密，会揭开沉重的面纱吗？
新兰，平和，快青，？哀，？默，涉美……这几对情侣的恋爱状况会怎样发展？
| 章节 | 标题 | 内容提要 | 字数 | 点击 | 更新时间 |
| 1 | 新的同学 | 帝丹小学一年级B班再次出现了新的同学，她是谁呢…… | 1341 | 2013-07-16 21:39:16 | |
| 2 | 约定与回忆 | 一个默与未知人物的约定，似曾相识的 | 2103 | 2013-07-18 21:39:16 | |
| 3 | 疑惑 | 面包店的偶遇，灰原肯定的心情 | 1343 | 2013-07-20 21:39:16 | |
| 4 | 噩梦 | 黑色的影子，那个可怕的噩梦…… | 1330 | 2013-07-22 21:39:16 | |
| 5 | 解答 | 扔垃圾，清洗这一切都只是借口？ | 1548 | 2013-07-30 19:18:24 | |
| 6 | 洞察 | Aquamarine，Topaz和Moonstone | 1687 | 2013-08-01 19:18:24 | |
| 7 | 探寻 | 想不出来了…… | 1472 | 2013-08-04 21:48:49 | |
| 8 | 来自黑暗深渊的魔掌 | 危机来临，双重心机！ | 2827 | 2013-08-06 21:48:49 | |
| 9 | 计划 | 于黑衣组织的决战，开始了吗？ | 2436 | 2013-08-09 19:04:34 | |
| 10 | Angel与秘密 | 组织的动作，兰的伤感，面对美和子和哀别样的提示，她的内心已经有了答案 | 2133 | 2013-08-14 11:17:32 | |
| 11 | 出逃 | 灰原他们虽然成功逃出牢狱，但半路上却被组织追赶，最后虽然成功逃脱，但是…… | 4144 | 2013-08-19 19:05:04 | |
| 12 | 危机 | 终于走出黑暗，面对柯南的又是什么样的故事？平次的加入，带来的是惊喜还是担心 | 3551 | 2013-08-25 22:05:59 | |
| 13 | 天坛一战 | 天坛一战，FBI助阵，真假小五郎，步步逼近的组织 | 4352 | 2013-09-18 22:07:18 *最新更新 |
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